Die Schwerpunkte der Professur in Forschung und Lehre liegen in erster Linie im Innovationsrecht und im Technologierecht (Technikrecht), zwei auf Interdisziplinarität zwischen Ingenieur-, Wirtschafts- und Rechtswissenschaften angelegten,  in ständiger Entwicklung befindlichen Bereichen. Hier ist Herr Prof. Dr. Müller in der jüngeren Zeit als Mitautor eines grundlegenden Werkes zum Technikrecht (2012, Springer-Verlag) sowie als Mitautor des von J. Ensthaler und P. Wege herausgegebenen Werkes „Management geistigen Eigentums“ (2013, ebenfalls Springer-Verlag) zum Technologieverwertungsrecht in Erscheinung getreten.

 Prof. Dr. Müller ist zudem Mitherausgeber der seit 2013 unter dem Dach des Deutschen Fachverlags erscheinenden Zeitschrift zum Innovations- und Technikrecht (InTeR), vgl. dazu auch die entsprechende Rubrik dieses Internetauftritts.

Das Innovationsrecht behandelt Themen der Innovationssteuerung durch Recht und im Recht, u. a. die Schutzwürdigkeit und Ausgestaltung des Schutzes von (technischen, schöpferisch-gestalterischen, unternehmensbezogenen, daneben aber auch sozialen) Innovationen, die Vermarktung von Innovationen im (Innovations-)Wettbewerb, die individuelle und kollektive Verantwortung für Innovationen sowie die gegenständlichen, infrastrukturbezogenen und humanzentrierten Vorbedingungen für die Entstehung von Innovationen. Im Technologie- und Technikrecht steht die Steuerung von Technologien bzw. von Technik anhand rechtlicher Instrumente im Vordergrund: Im Vordergrund stehen dabei neben Rechtsfragen einzelner Technologiesparten das technik- bzw. technologiebezogene Unternehmensrecht. Übergeordnete Fragestellungen des Innovations- und Technologierechts, die im Fokus der künftigen Forschungsaktivitäten der Professur liegen werden, sind zum einen die Herausbildung eines verbrauchergerechten und zugleich unternehmensverträglichen Technologierechts und zum anderen die Herausforderungen des demografischen Wandels für das Privatrecht und das Wirtschaftsrecht.

Neben dem Innovations- und Technikrecht widmet sich die Professur an der Universität Paderborn – den Schwerpunkten  der Universität selbst sowie der dortigen Fakultät für Wirtschaftswissenschaften entsprechend – ferner dem Recht der Unternehmensgründung (insb. mit Bezug zu IT-nahen Unternehmen und Tätigkeiten).